بر اساس قانون تشكيلات و و ظايف وزارت بهداشت ، درمان و آموزش پزشكي مصوب سوم خرداد67 ، تعيين ضوابط مربوط به ورود ، ساخت ،‌ نگهداري ،‌ صدور مجوز اين فعاليتها و انهدام تجهيزات و مواد مصرفي پزشكي ، دندانپزشكي ، آزمايشگاهي و توانبخشي و نيز ارزشيابي ، نظارت و كنترل اين ضوابط به عهده اين وزارتخانه است . همچنين مطابق ماده 14 قانون مقررات امور پزشكي ، دارويي و مواد خوراكي و آشاميدني مصوب 23 فروردين 67 ،‌ ساخت يا ورود هر نوع مواد و تجهيزات پزشكي ، دندانپزشكي يا مواد اوليه ، قطعات و بسته بندي آنها كه ليست سوي وزارت بهداشت ،‌ درمان و آموزش پزشكي اعلام مي شود بايد با اجازه قبلي و موافقت اين وزارتخانه انجام شود . ترخيص اين كالاها از گمرك نيز بايد با كسب اجازه از وزارت بهداشت انجام شود .
بر اساس اين ماده قانوني همچنين ورود هر نوع فرآورده آزمايشگاهي ،‌ قطعات و ماشين آلات آن به هر شكل از خارج كشور توسط بخش خصوصي يا دولتي و نيز ترخيص آنها از گمرك و همچنين ساخت هر نوع از اين كالاها ، عرضه و فروش آنها در داخل كشور يا صدور آن به خارج ، مستلزم اجازه قبلي از وزارت بهداشت ،‌  درمان و آموزش پزشكي است .
وزارت بهداشت ،‌ درمان و آموزش پزشكي بر اساس اين وظايف قانوني و براي اجراي آن " اداره كل تجهيزات پزشكي" را زير نظر قائم مقام وزير بهداشت در امور بازرگاني و مركز مديريت و هماهنگي امور بازرگاني اين وزارتخانه در چارت تشكيلاتي خود تعريف كرده است .
وظيفه اصلي اين اداره نظام مند كردن وضعيت تجهيزات پزشكي در كشور و نظارت بر نحوه توليد ،‌  واردات ،‌ توزيع ، عرضه ، مصرف ،‌ نگهداري ، صادرات ، ارتقاي كمي و كيفي توليدات وسايل پزشكي داخل كشور و نظارت بر كيفيت لوازم پزشكي وارداتي است .
تدوين و اجراي آئين نامه و منشور تجهيزات پزشكي وزارت بهداشت و دستورالعمل مبارزه با قاچاق تجهيزات پزشكي ،‌ ارزيابي و مديريت بازار اين تجهيزات در كشور با استفاده از اصول مديريت علمي در دو جنبه سلامت و اقتصاد به همين منظور در اين اداره انجام مي شود .
اداره كل تجهيزات پزشكي وزارت بهداشت براي انجام اين وظايف خود ، از اهرمهايي نظير صدور و ابطال مجوز ورود ، توليد و صادرات اين تجهيزات و نيز صدور اجازه فعاليت شركتهاي خدمات پس از فروش ،‌ توليدكننده و نمايندگي شركتهاي خارجي در كشور ، پيشنهاد تعرفه گمركي ورود و تعيين تعرفه خدمات پس از فروش اين تجهيزات بهره مي برد .
نيازسنجي تجهيزات پزشكي در كشور ، شناسنامه دار كردن شركتهاي تجهيزات پزشكي ، كدبندي و طبقه بندي اين تجهيزات ، كنترل اين تجهيزات در بازار ،‌ رسيدگي به شكايتهاي واصله و ارجاع موارد تخلف به مراجع قضايي از جمله اقداماتي است كه از سوي اداره كل تجهيزات پزشكي وزارت بهداشت انجام شده و يا در دست انجام است بازوهاي اجرايي اين اداره كل براي اين وظايف ، شش اداره شامل اداره نظارت بر توليد و كنترل كيفي ، اداره كارشناسي تجهيزات پزشكي ، اداره تجهيزات دندانپزشكي ،‌ اداره تجهيزات آزمايشگاهي ، اداره مهندسي و نگهداري ، اداره نظارت و ارزيابي و واحد IT هستند.